明智讲堂系列学术报告(何彬涛 博士)
学科建设与研究生办 2025-06-14 115

报告题目:基于点云框架的冷冻电镜密度图三维比对

报告时间:2025年6月18日(周三)上午10点

报告地点:28-414会议室

报告简介:冷冻电镜(cryo-EM)三维重建是当前生物大分子结构解析的首选技术。且随着相应软硬件的不断发展,成像解析出的中高分辨率密度图数量正在极速地长。其中准确的密度图比对分析大分子结构信息方面起着至关重要的作用,例如全局比对可以辅助识别分子构象柔性区域,局部比对在原子模型从头组装任务中是一个关键的步骤在此我们提出了一种快速准确的全局和局部冷冻电镜密度图通用比对方法CryoAlign,主要利用局部密度特征描述符来捕捉结构在空间中的相似性。CryoAlign将三维密度图转化为点云,采用基于几何特征的架构快速建立点对对应关系以及比对参数进行稳健估计。充分的实验评估表明,CryoAlign在比对精度和速度方面都优于现有方法。进一步地,我们也在CryoAlign的基础上实现了基于比对的密度图检索方案,为有效利用现有成像数据提供了一个选择。

报告人简介:何彬涛,山东大学2022级博士研究生,师从韩仁敏教授,研究方向为生物信息学,致力于通过算法设计和高性能计算让生信数据变得更“好”:更快,更易用,更精准,以学科交叉的形式解决生信数据处理算法和高效软件上的关键问题。获国家自然科学基金青年学生基础研究项目(博士研究生)资助,以第一/共同第一作者在Nature communications、ICCV、MM等国际知名期刊与会议发表学术论文6篇。曾获山东大学校长奖学金、国家奖学金、山东大学研究生优秀成果奖、山东省研究生创新成果等荣誉。